O município possui 9,8 mil empregos com carteira assinada, a ocupação predominante destes trabalhadores é a de professor de nível superior do ensino fundamental (primeira a quarta série) (815), seguido de atendente de lojas e mercados (521) e de vendedor de comércio varejista (424). A remuneração média dos trabalhadores formais do município é de R$ 2 mil, valor abaixo da média do estado, de R$ 2,9 mil.

A concentração de renda entre as classes econômicas em Francisco Morato pode ser considerada muito baixa e é relativamente inferior à média estadual. As faixas de menor poder aquisitivo (E e D) participam com 66% do total de remunerações da cidade, enquanto que as classes mais altas representam 3,3%. Destaca-se que composição de renda das classes mais baixas da cidade têm uma concentração 24,1 pontos percentuais maior que a média estadual, já as faixas de alta renda possuem participação 19,8 pontos abaixo da média.

Do total de trabalhadores, as três atividades que mais empregam são: administração pública em geral (2865), transporte rodoviário municipal (698) e comércio varejista de supermercados (676). Entre os setores característicos da cidade, também se destacam as atividades de administração pública em geral e transporte rodoviário municipal.